Сюжет книги – краткий пересказ
Лето и начало учёбы
Пока Гарри Поттер был на летних каникулах у своих родственников, он не получил ни одного сообщения или письма от своих лучших школьных друзей — Рона и Гермионы. В день своего 12-тилетия в комнату к нему аппарирует домашний эльф Добби, который предупреждает его, что если Гарри вернется на учебу в Хогвартс он будет в смертельной опасности. Гарри решает возвратиться, несмотря на рекомендации, мольбы и старания Добби остановить его с помощью магии (из-за чего Гарри попадает в затруднительное положение).
Дурсли прячут книги и палочку Гарри, пока он находится у них, делая из него заключённого, но братья Уизли (Рон, Фред и Джордж) помогают ему убежать от его родственников, с помощью летающей машины мистера Уизли. Семья Уизли встречает его у себя до начала учёбного периода в Хогвартсе. На вокзале Кингс-Кросс Гарри и Рон, не смогли пройти на перрон к волшебному поезду. В отчаянии, они берут машину отца Рона и летят в Хогвартс на ней. Случайно машина врезается в Гремучую иву, при этом ломается волшебная палочка Рона, а полуразбитый автомобиль сбегает от них.
На втором курсе обучения в школе Ведемства и Колдовства, Гарри оказывается в центре внимания трёх людей. Первый из них — новый преподаватель Защиты от Тёмных Искусств, профессор Златопуст Локонс, волшебник, который сам создаёт о себе легенды; второй — поклонник, Колин Криви, молодой грифиндорец, который любит делать фотографии; третий, точнее третья — сестра Рона, Джинни Уизли, влюблённая в Гарри.
Учебный год
В школе, как всегда, начинает происходить, что-то непонятное. Однажды, отрабатывая наказание у Локонса, Гарри слышит голос, который говорит об убийстве. Никто, кроме Поттера, этот голос не слышит. Гермиона убеждает, что лучше об этом никому не говорить, так как даже в магическом мире слышать то, чего не слышат другие — плохой признак. Гарри даёт свое согласие, но в следующий раз голос приводит их на место, залитое водой, где на канделябре висит кошка Филча Миссис Норрис, а на стене — кровавая надпись, говорящая о том, что открыта некая «тайная комната», и врагам наследника нужно этого бояться. Ребята в ужасе и недоумении. На уроке Гермиона спрашивает у Макгонагалл, что такое «тайная комната». Профессор неохотно рассказывает, что Салазар Слизерин - родоначальник факультета Слизерин, всегда был за то, чтобы в школе учились только чистокровные волшебники, но другие маги с ним не согласились. В конце концов Салазар ушёл, но, по легенде, оставил в Хогвартсе комнату, которую однажды должен открыть его наследник и избавиться от полукровок в школе. Легенде гласит, что в этой комнате находится чудовище, которым может управлять только наследник Слизерина. И ещё профессор упоминает о том, что эта комната давным-давно была уже открыта и тогда погибла одна со студенток школы.
Гарри, Рон и Гермиона сразу начинают подозревать Драко Малфоя, так как тот всегда высказывался против полукровок. Гермиона предлагает сварить Оборотное зелье, которое позволит Гарри и Рону превратиться в двух лучших друзей Драко и пойти выпытать у Малфлоя информацию. Ребята соглашаются. Местом для варки запрещённого зелья становится женский туалет, в котором живет призрак Плакса Миртл. Усыпив Крэбба и Гойла при помощи кексов с сонным зельем, Гарри и Рон берут их волосы и, добавив в зелье, сваренное Гермионой, превращаются в друзей Малфоя. Гермионе не везёт: вместо волоса Милисенты Булстроуд из Слизерина ей попался волос её кошки, и она превращается в получеловека-полуживотное. Гарри и Рон приходят к Драко и пытаются выпытать, кто открывает комнату, но, к их удивлению, оказывается, что Малфой ничего не знает.
Снегг и Локонс открывают в школе «клуб дуэлянтов», призванный показать ученикам, как нужно защищаться, если на них кто-то нападёт. Локонс выступает против Снегга, и становится понятно, что он абсолютный профан в этом деле. Снегг предлагает устроить дуэль между учениками. Локонс выставляет Гарри, Снегг — Малфоя. Ребята равны по силе, но Драко выпускает из палочки змею. Змея хочет напасть на ученика, но Гарри начинает с ней говорить и змея успокаивается. Так все узнают, что Гарри — змееуст. Гермиона объясняет Поттеру, что считается, что способность говорить со змеями связана с тёмной магией. Очень многие ученики школы начинают считать, что именно Гарри Поттер является наследником Слизерина.
Тем временем жертвами неизвестного становятся привидение Почти Безголовый Ник и ещё один ученик (Джастин Финч-Флетчли), а Гарри снова оказывается на месте преступления. Дамблдор приглашает Гарри к себе в кабинет и спрашивает его, не хочет ли тот ему что-то сказать, но Гарри боится признаться Дамблдору в своих страхах и ничего не говорит.
Гарри находит в туалете Миртл странную книгу, на которой написано, что это собственность некоего Тома Реддла. Дневник показывает Гарри воспоминание молодого Реддла про тайную комнату. По этому видению получается, что комнату в прошлый раз открывал Хагрид. Гарри не верит этому. Вскоре дневник пропадает из его комнаты.
Гарри и Рон хотят расспросить Хагрида, но того неожиданно забирают в Азкабан. Он лишь успевает намекнуть друзьям, что всё было ошибкой, и если ребята хотят узнать все подробнее, то пусть идут за пауками. Действительно, по непонятной причине из школы бегут пауки: в запретный лес тянется их цепочка. Гарри и Рон идут за пауками и встречаются с Арагогом, огромным черным пауком. Арагог говорит, что он — тот монстр, которого воспитывал Хагрид, но он — не чудовище Слизерина, и лесничий никогда не открывал тайную комнату. Настоящее же чудовище скрывается в замке, и пауки боятся его так, что даже не произносят его имени.
Жертвой неизвестного существа становится сама Гермиона, которая возвращалась из библиотеки. Ребята находят в её кулаке листок, на котором описывается василиск. Друзья понимают, что чудовище Тайной комнаты и есть василиск. Тем временем, на стене рядом с туалетом девочек появляется надпись, что в Тайной комнате находится ученик школы, и он останется там навечно. Школу должны закрыть, но ребята, расспросив Миртл, понимают, где находится вход в комнату. Они зовут Локонса, который пытается сбежать из школы, и вместе с трусливым профессором спускаются в комнату. Там Локонс пытается напасть на детей и применить единственное заклятие, которое он знает хорошо — заклинание Забвения, — но палочка Рона, которой воспользовался профессор, неисправна, поэтому память стирается у самого Локонса. Более того, рушится стена, и Гарри с Роном оказываются по разные стороны от обвала.
Тайная комната
Гарри добирается до большого зала, где без сознания лежит Джинни, и встречает возле неё Тома Реддла. Тот рассказывает, что это он управлял Джинни при помощи своего дневника. Реддл показывает Гарри, что он — Волан-де-Морт, запечатливший свои воспоминания в дневнике, надеясь однажды продолжить то, что он начал, когда впервые открыл Тайную комнату пятьдесят лет назад, когда учился в Хогвартсе. Тогда в нападениях обвинили Хагрида и отчислили из Хогвартса.
Том говорит, что, когда Джинни умрет, он станет вновь телесным, а не просто воспоминанием, так как дневник отнимает силы сестры Рона. После этого он пытается убить Гарри, натравив на него василиска (существо, способное взглядом превращать своих жертв в камень).
Гарри сражается с василиском, в чем ему помогает феникс Фоукс, который выклевывает глаза василиска (их взгляд несёт смерть) и приносит Распределяющую Шляпу, из которой появляется меч Гриффиндора. Мечом Гарри побеждает василиска и при помощи его зуба уничтожает дневник Реддла. Реддл исчезает. Джинни приходит в себя. Все вместе ребята улетают из Тайной комнаты на хвосте феникса.
Гарри приходит к Дамблдору в кабинет, там же появляется Люциус Малфой со своим домовым эльфом Добби. Гарри, догадавшийся, что именно Люциус подкинул Джинни дневник, кладёт внутрь свой носок, бежит за Малфоем и отдает дневник ему. Люциус отдает дневник Добби, тот берет носок и оказывается свободным. Домовой эльф освобожден, он готов сделать для Гарри все, что он пожелает, но тот просит только никогда не пытаться спасти ему жизнь.
Все пострадавшие от василиска были вылечены при помощи корня мандрагоры, Златопуст Локонс попадает в госпиталь магических болезней святого Мунго. Хагрид был оправдан и вернулся в Хогвартс уже в качестве преподавателя.